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實時熒光定量pcr儀百科知識
發布時間:2025-04-30 09:27:53

實時熒光定量PCR儀百科知識


1. 定義與概述

實時熒光定量PCR儀(Real-Time Quantitative PCR, qPCR)是一種基于聚合酶鏈式反應(PCR)技術,通過熒光信號實時監測DNA擴增過程的高精度分子生物學儀器。
核心功能:

  • 定量檢測DNA/RNA的初始模板量(絕對定量或相對定量)。

  • 檢測基因表達水平、病原體載量、基因突變等。

  • 廣泛應用于疾病診斷、基因研究、食品安全檢測等領域。


2. 核心技術原理

  • 熒光標記機制:

    • TaqMan探針法:探針帶有熒光基團和淬滅基團,擴增時探針水解釋放熒光。

    • SYBR Green法:染料嵌入雙鏈DNA發出熒光,成本低但特異性稍差。

    • 分子信標(Molecular Beacon):莖環結構探針,靶序列結合后發光。

  • 檢測模式:

    • 終點法:僅檢測最終產物量。

    • 實時法:通過Ct值(閾值循環數)動態分析擴增曲線,實現精準定量。


3. 核心參數與性能指標

參數意義典型范圍/要求
檢測通道數支持多色熒光檢測能力(如FAM, HEX, ROX)1-6通道(多用于多重PCR)
靈敏度最低可檢測DNA拷貝數單拷貝(<10 copies/μL)
溫控精度溫度均一性和升降溫速率±0.1°C,升降溫≥4°C/秒
動態范圍線性定量范圍(Log值)7-8個數量級(10^1~10^8拷貝)

4. 主要應用場景

  • 臨床診斷:

    • 病毒/細菌核酸檢測(如新冠病毒、HPV、結核分枝桿菌)。

    • 腫瘤基因突變檢測(EGFR、KRAS等)。

  • 科研領域:

    • 基因表達分析(mRNA定量)。

    • miRNA檢測、SNP分型。

  • 農業與食品:

    • 轉基因成分鑒定。

    • 食源性致病菌(如沙門氏菌)快速檢測。


5. 與傳統PCR的對比

特性實時熒光定量PCR傳統PCR
定量能力實時監測,精準定量(基于Ct值)僅終點定性/半定量(電泳分析)
檢測速度1-2小時(含數據分析)2小時+額外電泳時間
污染風險閉管操作,污染風險低開蓋電泳,易污染
成本較高(熒光試劑/探針)

6. 操作流程與注意事項

  • 標準流程:

    1. 樣本制備:提取DNA/RNA并反轉錄為cDNA(RNA檢測時)。

    2. 反應體系配制:加入引物、探針、模板、Taq酶等。

    3. 程序設置:設定擴增程序(預變性→循環擴增→熔解曲線分析)。

    4. 數據分析:通過軟件計算Ct值,生成標準曲線或相對表達量。

  • 關鍵注意事項:

    • 避免RNA降解(使用RNase抑制劑)。

    • 防止交叉污染(分區操作、UNG酶防殘留)。

    • 驗證引物特異性(熔解曲線單峰)。


7. 主流品牌與型號

品牌代表型號特點
Bio-RadCFX96高性價比,5通道檢測,適合中小型實驗室
Thermo FisherQuantStudio 5模塊化設計,支持高通量(384孔板)
RocheLightCycler 480超快升降溫(19°C/秒),精準溫控
QiagenRotor-Gene Q離心式溫控,均一性好,適合低濃度樣本

8. 未來發展趨勢

  • 數字化PCR(dPCR):通過微滴分區實現絕對定量,無需標準曲線。

  • 便攜化設備:手持式qPCR儀(如BioFire FilmArray)用于床邊檢測。

  • AI整合:自動優化引物設計、智能分析擴增異常曲線。

  • 多重檢測升級:支持10+靶標同步檢測(如病原體panel篩查)。


9. 常見問題(FAQ)

  • Q:是否必須做標準曲線?
    A:絕對定量需要標準品繪制曲線;相對定量(如2^-ΔΔCt法)可不依賴標準曲線。

  • Q:熔解曲線出現多峰怎么辦?
    A:可能為引物二聚體或非特異擴增,需優化引物濃度或退火溫度。

  • Q:如何提高低濃度樣本的檢測靈敏度?
    A:增加模板體積、使用高靈敏度探針(如TaqMan MGB)、減少抑制劑干擾。


總結

實時熒光定量PCR儀憑借高靈敏度、快速定量、閉管防污染等優勢,已成為分子診斷和基因研究的核心技術平臺。隨著數字化、微流控等技術的融合,其在精準醫學和即時檢測(POCT)中的應用將更加廣泛。

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