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實時熒光pcr分析儀百科知識
發布時間:2025-06-18 09:26:41

定義

實時熒光PCR分析儀是一種將傳統PCR擴增與熒光信號檢測同步進行的高精度分子生物學設備。通過在PCR反應體系中加入熒光標記物(探針或染料),實時監測擴增過程中熒光強度的變化,實現對目標核酸(DNA/RNA)的定量(絕對/相對)或定性分析,無需后期電泳檢測。


核心原理

  1. PCR擴增基礎

    • 遵循聚合酶鏈式反應(PCR)三步驟:變性(高溫解鏈DNA)、退火(引物結合模板)、延伸(合成新鏈)。

  2. 熒光信號生成

    • TaqMan探針:5'端報告基團(FAM),3'端淬滅基團(TAMRA),水解后釋放熒光。

    • 分子信標:莖環結構,結合靶序列后發夾打開,熒光恢復。

    • 雙雜交探針:相鄰探針發生FRET能量轉移產生熒光。

    • SYBR Green等染料嵌入雙鏈DNA,發射熒光(強度與產物量成正比)。

    • 缺點:易受非特異產物干擾。

    • 熒光染料法(非特異性):

    • 熒光探針法(特異性):

  3. 實時監測

    • 每輪循環結束時檢測熒光強度,生成擴增曲線。

    • 閾值線(Threshold):背景熒光以上的設定值,與Ct值相關。

    • Ct值(Cycle Threshold):熒光強度達到閾值時的循環數,與起始模板量負相關(定量依據)。


核心組件

組件功能
熱循環模塊精確控制溫度(±0.1℃),實現變性、退火、延伸的快速切換。
光學檢測系統- 光源:LED、鹵鎢燈或激光器
- 濾光片/光柵:選擇激發/發射波長
- 檢測器:CCD或PMT捕獲熒光信號
多通道檢測支持4-6色熒光通道(如FAM, HEX, ROX, Cy5),實現多重檢測。
溫控技術- Peltier半導體溫控:主流技術
- 離心式空氣加熱(快速PCR儀)
軟件與分析模塊控制儀器運行,分析擴增曲線、計算Ct值、生成標準曲線、輸出定量/熔解曲線結果。

工作流程

  1. 樣本準備:提取核酸(DNA/RNA),構建反應體系(引物、探針、酶、dNTPs)。

  2. 加樣:轉移至專用PCR管或96/384孔板。

  3. 程序設置:

    • 溫度程序(預變性→循環擴增→延伸)

    • 熒光通道選擇(根據染料/探針波長)

  4. 實時監測:每輪循環結束采集熒光信號。

  5. 數據分析:

    • 定量分析:通過標準曲線計算模板拷貝數(絕對定量)或相對表達量(如2<sup>?ΔΔCt</sup>法)。

    • 定性分析:熔解曲線分析(SYBR Green法驗證產物特異性)。

    • 陽性判定:Ct值≤預設閾值(通常35-40)。


關鍵性能參數

參數意義
檢測靈敏度最低可檢出模板量(可達單拷貝級別)。
動態范圍可準確定量的濃度范圍(通常跨越6-8個數量級)。
分辨率區分濃度差異的能力(如±1.5倍差異)。
通量單次運行樣本數(96孔/384孔板,高通量機型支持數千樣本/天)。
升溫/降溫速率影響PCR速度(常規儀器:3-5°C/秒;快速PCR儀:>10°C/秒)。
多色檢測能力支持同步檢測的熒光通道數(4-6通道為主)。

主要應用領域

  1. 病原體檢測

    • 病毒(COVID-19、流感、HIV)、細菌(結核分枝桿菌)、寄生蟲的快速診斷。

  2. 基因表達分析

    • mRNA定量(qRT-PCR),研究基因調控機制。

  3. 基因分型與突變檢測

    • SNP分析、插入/缺失鑒定(探針法或熔解曲線分析)。

  4. 轉基因檢測

    • 食品/作物中轉基因成分定量(如35S啟動子、NOS終止子)。

  5. 藥物開發與藥效評估

    • 靶基因表達水平監測。

  6. 法醫學

    • DNA指紋圖譜、親子鑒定。


優勢與局限性

優勢局限性
? 高靈敏度與特異性? 易受抑制劑影響(血色素、肝素等)
? 閉管操作,降低污染風險? 引物/探針設計難度高(尤其多重檢測)
? 定量范圍廣,無需后期處理? 設備及試劑成本較高
? 快速獲得結果(1-2小時)? 對實驗操作規范性要求嚴格
? 支持多重檢測(多靶標同步分析)? 絕對定量需標準品(增加復雜性)

使用注意事項

  1. 防污染措施:

    • 分區域操作(試劑準備區→樣本處理區→擴增區)。

    • 使用帶濾芯吸頭、UV燈消毒工作臺。

  2. 質量控制:

    • 設置陰性對照(無模板)、陽性對照、內參基因(如GAPDH)。

  3. 探針/染料選擇:

    • 多重檢測需避免光譜重疊。

  4. RNA檢測:

    • 需逆轉錄步驟(qRT-PCR),嚴防RNA酶污染。


發展趨勢

  1. 便攜化與現場檢測

    • 手持式/床旁快速PCR儀(如用于突發疫情現場篩查)。

  2. 自動化整合

    • 與核酸提取儀、液體處理工作站聯用,構建全自動檢測線。

  3. 數字PCR(dPCR)互補

    • 提供絕對定量無需標準曲線,適用于低豐度靶標分析。

  4. 多重檢測能力提升

    • 發展10色以上熒光系統,實現超多重靶標同步檢測。

  5. AI輔助分析

    • 自動識別異常擴增曲線,優化結果判讀準確性。


代表廠商與機型

  • 賽默飛世爾(Thermo Fisher):QuantStudio 5/7, StepOnePlus

  • 伯樂(Bio-Rad):CFX96/384, CFX Opus

  • 羅氏(Roche):LightCycler 480/96

  • 安捷倫(Agilent):AriaMx

  • 國產平臺:宏石(SLAN)、博日(LineGene)

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